一、石墨坩堝易受損
    盡管石墨坩堝具有較高的耐高溫、耐腐蝕性，但是使用過程中很簡單磕碰和摔壞。與其他原料的坩堝相比，石墨坩堝的價格也較高，如果坩堝破損，需求更換，形成必定的經濟損失。
二、石墨坩堝的結構設計不行合理
    石墨坩堝的結構設計存在必定的缺乏，例如石墨坩堝壁薄并且易于變形，長期的使用簡單導致坩堝變形甚至決裂。此外，坩堝壁比較光滑，難以涂附瘤子或墊料，導致在重量不穩定資料的加熱過程中，簡單出現資料附著和黏結的情況，影響反響的進行。
三、石墨坩堝不適合于一些化學反響
    石墨坩堝本身就是碳素資料，如果用于一些需求反響的化學物品會發生化學反響，形成新的化合物，這將影響試驗數據的準確性。此外，石墨坩堝用于多數氧化復原反響，相對于鋁制坩堝、陶瓷坩堝簡單紅化，發生氣體漏氣現象。
四、石墨坩堝外表易發生氧化
    由于石墨坩堝外表會發生必定程度的氧化，這可能會影響試驗結果，導致試驗的準確性下降。
    綜上所述，盡管石墨坩堝具有耐高溫、耐腐蝕的特性，并且是廣泛應用于高溫試驗領域中的儀器之一，但其存在易碎、結構設計不合理、不適用于某些化學反響和易氧化等缺乏之處。因而，在試驗中選用試驗坩堝應該根據具體條件綜合考慮。